病菌菌株的鉴别对于流行性疾病暴发的控制至关重要。然而，传统的基于细菌培养的诊断方式却困难重重。宏基因组学（metagenomics）方法从多种微生物混杂样品中提取DNA直接用于测序，被认为是一种不需要实验室培养即可完成暴发菌株鉴定的无限制临床检验平台。为了探索其潜在价值，英国伯明翰大学（University of Birmingham）微生物感染研究所的研究者进行了深入研究，相关论文发表于国际权威杂志《JAMA》上。
研究者用宏基因组学对2011年德国产志贺毒素型大肠杆菌暴发所做的分析中，成功地对一个疾病暴发菌株的基因组序列进行了重建。研究表明，用这种方法具有比基于细菌培养的方法更快识别并描述细菌性病原体特征的潜力。
研究人员最终得出结论，在某一腹泻性疾病暴发时，宏基因组学具有识别和描述细菌性病原体特征方法的潜力。不过研究者同时提出，宏基因组学方法所面临的挑战包括加速及简化工作流程、降低成本及提高诊断的敏感性，而这些需要依赖基因测序技术的改善。
（责任编辑：陈雪礼）
